Артем, Вы, конечно, извините, что навязываюсь, но, по-моему, в Вашем случае вариант как раз есть - Picking list (отгрузочная, кажется, накладная) с последующей регистрацией. В целом, соглашусь с Глебом (как всегда

)
Кстати, ведь даже при работе с отрицательным складом Аксапта не зарезирвирует больше того, чем доступно. Или я не прав?