Насколько я понимаю, это исправление той ситуации, что в 3.0 поле заполнялось всегда и не было никакой возможности это предотвратить.
Теперь получилась другая крайность.
Оставьте галку. Сумма на самом деле не задваивается, поскольку лежит в другом типе учета и на "нормальное" сальдо не влияет.