У нас сделано так. Есть понятие "главный склад", который является интерфейсом с внешним миром (закупки приходят на него), и много "складиков" подразделений. Все эти склады прописаны в таблице InventLocation. Между ними товар разруливается посредством перемещений в соответствии с производственной необходимостью (порождая записи в таблице InventTrans). В момент ввода в эксплуатацию "товар" списывается с того склада, где он находится в этот самый момент - уходя из модуля "Управление запасами" и "начиная жизнь" в модуле "Основные средства"
ВИНОВАТ! НЕ УВИДЕЛ, ЧТО ОТСУТСТВУЕТ МОДУЛЬ УЗ