Это у вас Axapta 3.0 и Windows XP? Вот это да!!
В древних версиях системы была форма SQL Administration или типа того, и какая-то кнопка справа для лечения и перестройки индексов?
Вот, нашел в чуть менее раритетной системе:
Кажется, лет десять назад было еще принято удалять строки в SQLDICTIONARY и пересинхронизировать.