Было дело... наверно... я клиппер в то время обошёл стороной.
Так ведь "не работали"!
Припомните случай, чтоб "работали, но по другому"
Может, просто дело в алгоритме закрытия? Может, результат неустойчив относительно порядка обработки? Т.е. при перезаливке данных меняется порядок следования данных, а где-то в алгоритме нет принудительной сортировки какой-нить таблицы - и данные выгребаются в другом порядке?
Для "спокойствия" забэкапьте и поднимите всю базу средствами MSSQL и убедитесь в идентичности результата...
Ээхх..

Килппер... Были времена....