У меня была такая же проблема
Таблицы, созданные в usr-слое, не импортируются
Т.е. в .xpo они видны, но в АОТ после импорта не появляются.
Остальные объекты, кроме таблиц, появляются
Проблема решалась как-то по-дурацки: созданием в базе таблиц (пустых) с таким же наименованием, что и импортируемые. После этого импорт, и в базе готовые таблицы

Но когда много таблиц, это реально напрягает. Есть решение проще?